Theo Điều 6 Thông tư 91/2026/TT-BTC, doanh nghiệp thông thường thực hiện đăng ký thông qua tổ chức cung cấp dịch vụ hóa đơn điện tử bằng Tờ khai mẫu 01/ĐKTĐ-HĐĐT. Sau khi gửi tờ khai, doanh nghiệp cần theo dõi thông báo tiếp nhận, thực hiện bước xác nhận danh tính/thông tin theo yêu cầu và chờ thông báo chấp nhận đăng ký trước khi bắt đầu sử dụng.
Một số trường hợp có kênh đăng ký khác: doanh nghiệp truyền dữ liệu hóa đơn trực tiếp đến cơ quan thuế có thể đăng ký qua Hệ thống thông tin quản lý thuế hoặc Cổng Dịch vụ công Quốc gia; đối tượng được miễn phí dịch vụ hóa đơn có mã có thể được áp dụng kênh đăng ký riêng theo quy định.

Trước khi điền tờ khai, doanh nghiệp nên kiểm tra khả năng sử dụng hóa đơn không có mã và trường hợp phải sử dụng hóa đơn từ máy tính tiền theo Điều 6 Nghị định 254/2026/NĐ-CP. Không nên mặc định mọi doanh nghiệp đều được chọn cùng một loại hóa đơn.
Xác định loại hóa đơn phù hợp với lĩnh vực hoạt động, điều kiện hạ tầng và yêu cầu quản lý thuế. Với doanh nghiệp đăng ký theo phương thức phổ biến, lựa chọn tổ chức cung cấp dịch vụ hóa đơn điện tử và truy cập chức năng đăng ký trên hệ thống của đơn vị đó. Trường hợp thuộc diện truyền dữ liệu trực tiếp, sử dụng kênh đăng ký được pháp luật cho phép.
Điền nội dung theo mẫu tại Phụ lục III Thông tư 91/2026/TT-BTC. Kiểm tra kỹ thông tin nhận diện doanh nghiệp, người đại diện, hình thức sử dụng hóa đơn, thông tin liên lạc và các lựa chọn nghiệp vụ theo biểu mẫu hiển thị. Thực hiện ký và gửi điện tử theo hướng dẫn của hệ thống đã chọn.
Hệ thống gửi thông báo tiếp nhận hoặc không tiếp nhận tờ khai. Trong 01 ngày làm việc kể từ khi nhận đăng ký, hệ thống đối chiếu thông tin của người đại diện/chủ doanh nghiệp với dữ liệu liên quan, bao gồm xác thực theo quy định. Khi thông tin khớp, người nộp thuế nhận yêu cầu xác nhận qua email hoặc số điện thoại trong hồ sơ đăng ký; việc xác nhận phải hoàn thành trong ngày làm việc hoặc chậm nhất ngày làm việc tiếp theo. Không thực hiện đúng hạn có thể dẫn đến thông báo không chấp nhận.
Nếu đã xác nhận đúng hạn và không thuộc diện phải kiểm tra bổ sung, cơ quan thuế thông báo chấp nhận chậm nhất vào ngày làm việc tiếp theo theo Điều 6 Thông tư 91/2026/TT-BTC. Trường hợp có dấu hiệu cần làm rõ, cơ quan thuế có thể yêu cầu giải trình, bổ sung tài liệu hoặc xác minh hoạt động tại địa chỉ đăng ký. Thời hạn giải trình là 03 ngày làm việc kể từ ngày nhận thông báo yêu cầu.
Khi có thông báo chấp nhận, doanh nghiệp kiểm tra lại thông tin hóa đơn, phân quyền lập và ký hóa đơn, cấu hình chuyển dữ liệu và thử quy trình nội bộ trước khi phát hành hóa đơn thực tế. Không xem thông báo “đã tiếp nhận tờ khai” là thông báo “chấp nhận đăng ký”.
Theo Điều 6 Nghị định 254/2026/NĐ-CP, doanh nghiệp cần xác định hình thức áp dụng dựa vào lĩnh vực và điều kiện thực tế, thay vì chọn chỉ theo sở thích:
|
Hình thức |
Lưu ý khi đăng ký |
|
Có mã của cơ quan thuế |
Hình thức áp dụng phổ biến đối với các chủ thể thuộc diện quy định; dữ liệu được cấp mã theo cơ chế tương ứng. |
|
Không có mã của cơ quan thuế |
Chỉ áp dụng nếu doanh nghiệp đáp ứng ngành nghề, hạ tầng, phần mềm, yêu cầu truyền dữ liệu và không thuộc trường hợp bị loại trừ. |
|
Khởi tạo từ máy tính tiền |
Cần xem xét ở hoạt động bán hàng, cung cấp dịch vụ trực tiếp cho người tiêu dùng thuộc nhóm quy định; có quy định về trường hợp đã đăng ký hình thức khác. |
Trước tiên, đọc rõ loại thông báo và lý do. Nếu thông tin doanh nghiệp hoặc người đại diện không khớp, cần điều chỉnh dữ liệu nguồn hoặc thông tin tờ khai theo hướng dẫn. Nếu bỏ lỡ xác nhận qua email/số điện thoại, thực hiện lại thủ tục đăng ký theo chỉ dẫn. Nếu được yêu cầu giải trình hoặc xác minh, chuẩn bị tài liệu chứng minh hoạt động và phản hồi trong thời hạn thông báo; tránh gửi đi nhiều bộ hồ sơ mâu thuẫn.
Đối với thay đổi thông tin đăng ký sau khi đã được chấp nhận, sử dụng thủ tục thay đổi thông tin theo mẫu và kênh quy định tại Điều 6 Thông tư 91/2026/TT-BTC; không tự ý sửa dữ liệu trên phần mềm mà bỏ qua nghĩa vụ thông báo khi pháp luật yêu cầu.
Để đăng ký hóa đơn điện tử doanh nghiệp, trước hết xác định đúng loại hóa đơn và kênh nộp, hoàn tất mẫu 01/ĐKTĐ-HĐĐT, thực hiện xác nhận thông tin đúng hạn rồi theo dõi thông báo chấp nhận của cơ quan thuế. Đặc biệt, doanh nghiệp nên rà soát quy trình theo quy định có hiệu lực từ ngày 01/07/2026 thay vì làm theo hướng dẫn cũ.